作为长江经济带的重要节点城市，南京正积极构建海港枢纽经济区，以抓住国家依托黄金水道推动发展的机遇。为实现这一目标，南京制定了《南京海港枢纽经济区建设三年行动计划》，旨在打造现代化国际海港、便捷的综合交通集疏运体系、完善的交易集散分销配送体系以及航运服务支撑体系。
南京计划投资630亿元，其中175亿元将用于建设南京长江航运物流中心。这一中心将成为现代化国际海港，具备强大的航运物流能力。南京还在构建“两环两横十二射”等交通骨架，打造便捷的综合交通集疏运体系。为了推进以港口为重点的立体交通综合体系建设，南京还将在龙潭、西坝等地构建多种运输方式无缝衔接的多式联运枢纽体系。这些建设预计在2015年至2017年间完成，投资总额达63亿元。
在打造江海转运主枢纽港方面，南京适应航道深水化及船舶大型化发展趋势，计划打造“六型港口”，并加快专业化泊位建设。特别是龙潭和西坝两大核心港区将基本建成，七坝港区也将开工建设。这将大大提高港口的转运能力，增强南京在江海转运中的主导地位。投资额度达35亿元，涉及11个新开工建设及4个续建码头项目。
在交易集散分销配送方面，南京将依托港口节点枢纽能力，重点建设多个物流园区和交易基地。这将促进专业物流与专业产品交易市场的一体化发展，提高物资交易和集散的效率。南京还将打造航运服务支撑体系，结合滨江商务区开发，建设航运管理机构、航运企业总部等功能片区，打造长江流域的五大中心。南京航运交易所的建设也将提供多元化的航运服务，成为企业总部集聚、配套服务完善的现代航运物流服务集聚区。这一阶段计划投资57亿元，涉及多个新开工建设及续建项目。
南京海港枢纽经济区建设的蓝图已经清晰，各项建设工作正有序推进。在未来三年中，南京将充分利用国家依托黄金水道推动长江经济带发展的机遇，努力打造现代化海港、便捷的综合交通体系、完善的交易集散体系和强大的航运服务支撑体系，进一步提升其在长江经济带中的地位和影响力。