一、主题曲/片头曲
《生生世世爱》
由吴雨霏倾情演唱的《生生世世爱》，作为全剧的灵魂曲目，贯穿整个《仙剑三》的主线剧情。这首歌曲改编自英文曲，带有浓厚的电子摇滚风格，每一旋律都仿佛诉说着深深的情感与纠葛。
二、片尾曲
《忘记时间》
胡歌演唱的《忘记时间》以其抒情的旋律和诗意的歌词，表达了时光流逝与情感羁绊的深刻情感。这首歌收录于胡歌的专辑《蓝光》中，是许多剧迷心中的经典之作。
三、插曲
《此生不换》
青鸟飞鱼演唱的《此生不换》展现了角色间跨越时空的深情厚意，其悲壮动人的旋律仿佛在为这段不凡的情感送行。
《答应不爱你》
郑中基以其温柔的声线诠释了“爱而不得”的无奈情感，他所演唱的《答应不爱你》被誉为剧中的“最美插曲”，每一句歌词都充满了深深的遗憾与不舍。
《偏爱》
摇滚曲风的《偏爱》，由张芸京演唱，其直白的歌词使之成为了现象级的流行曲。这首歌还曾获得“年度十大金曲”奖，足以证明其音乐品质与影响力。
《光棍》
胡歌演唱的《光棍》以其诙谐轻快的曲调，完美贴合了剧中景天的喜剧形象，为剧情增添了许多欢乐元素。
《你是我一首唱不完的歌》
郭蘅祈的《你是我一首唱不完的歌》是纯吟唱配乐，其婉转凄美的旋律常用于剧中的重要情感场景，为剧情增添了许多感人瞬间。
四、其他配乐
剧中的角色主题音乐如《雪见—落入凡尘》、《龙葵—千年等待》、《长卿—众生平等》等，以场景化的旋律深化了角色的塑造。经典游戏音乐的改编，如《御剑江湖》、《玉满堂》等游戏原声音乐的变奏版，也被巧妙地融入剧中，为剧情增添了更多的层次感和情感。
这些歌曲和配乐通过多元的风格与剧情融合，成为了《仙剑三》情感表达的重要载体。它们不仅在当时受到广大观众的喜爱，至今仍被广泛传唱和讨论，成为了一代人的青春记忆。